Schon bei seiner ersten Sportphysiologievorlesung an der Universität wurde Jonatan Ruiz auf die Beziehung zwischen Gesundheit und Sport aufmerksam. Seitdem beschäftigt er sich eingehend mit diesem Bereich. Kürzlich verlieh ihm die AstraZeneca-Stiftung den Preis für junge Forscher, die den Diabetes mellitus Typ 2 und Arten der Fettleibigkeit untersuchen. Er ist Ramón-y-Cajal-Stipendiat an der Sportwissenschaftsfakultät der Universität Granada, wo er Möglichkeiten zur Aktivierung von plurivakuolären Fettgewebe über sportliche Aktivitäten erforscht. Es handelt sich dabei um ein Gewebe, das Wärme erzeugt und den Glukosespiegel im Blut reguliert. Seine Forschungsergebnisse sollen zur Behandlung und Vorbeugung von Krankheiten wie Diabetes dienen. Zudem arbeitete Jonatan Ruiz bereits mit mehreren internationalen Institutionen zusammen, darunter das Karolinska-Institut in Schweden.